MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 11568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012028	AGTA	2	8	5	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012028	ATGT	2	8	57	64	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012028	TTAC	2	8	73	80	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012028	GAA	2	6	117	122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012028	GTG	2	6	135	140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012028	TG	3	6	139	144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012028	GGT	2	6	181	186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012028	GAA	2	6	334	339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475683
9	NC_012028	TGT	3	9	369	377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475683
10	NC_012028	TCCAC	2	10	489	498	20 %	20 %	0 %	60 %	222475683
11	NC_012028	GAA	2	6	637	642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475683
12	NC_012028	ATA	2	6	689	694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222475683
13	NC_012028	T	6	6	717	722	0 %	100 %	0 %	0 %	222475683
14	NC_012028	GATT	2	8	782	789	25 %	50 %	25 %	0 %	222475683
15	NC_012028	CTA	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475683
16	NC_012028	GCA	3	9	967	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475683
17	NC_012028	ATT	2	6	1124	1129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222475683
18	NC_012028	GCA	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475683
19	NC_012028	CAA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475683
20	NC_012028	ATC	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475683
21	NC_012028	CTC	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475683
22	NC_012028	ATTT	2	8	1368	1375	25 %	75 %	0 %	0 %	222475683
23	NC_012028	ACG	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475683
24	NC_012028	GAC	2	6	1387	1392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475683
25	NC_012028	TCAAG	2	10	1418	1427	40 %	20 %	20 %	20 %	222475683
26	NC_012028	GT	3	6	1460	1465	0 %	50 %	50 %	0 %	222475683
27	NC_012028	ACC	2	6	1503	1508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475683
28	NC_012028	GTG	2	6	1585	1590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012028	GTC	2	6	1592	1597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012028	TGGTG	2	10	1614	1623	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012028	GTG	2	6	1641	1646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012028	CGC	2	6	1657	1662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_012028	CT	3	6	1736	1741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012028	TC	3	6	1883	1888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012028	CTAT	2	8	1965	1972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012028	AT	3	6	1985	1990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012028	TCT	2	6	2005	2010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012028	CTG	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012028	AG	3	6	2122	2127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012028	T	7	7	2156	2162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012028	GTT	2	6	2166	2171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012028	ACAGC	2	10	2252	2261	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_012028	TAC	2	6	2298	2303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012028	CTG	2	6	2330	2335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012028	TTC	2	6	2344	2349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012028	CAGC	2	8	2370	2377	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012028	ACA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012028	AGC	2	6	2429	2434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012028	TTA	2	6	2438	2443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012028	TATACA	2	12	2462	2473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_012028	CGCT	2	8	2521	2528	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012028	CGA	2	6	2666	2671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012028	GA	3	6	2670	2675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012028	ACGG	2	8	2679	2686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012028	GCTGTC	2	12	2698	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012028	GGC	2	6	2710	2715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012028	GCC	2	6	2721	2726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_012028	CACT	2	8	2743	2750	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012028	TCGG	2	8	2763	2770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012028	GTC	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475684
61	NC_012028	TCG	2	6	2849	2854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475684
62	NC_012028	CCA	3	9	2882	2890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475684
63	NC_012028	CGCC	2	8	2898	2905	0 %	0 %	25 %	75 %	222475684
64	NC_012028	CGG	2	6	2907	2912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475684
65	NC_012028	CAC	3	9	2969	2977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475684
66	NC_012028	CAG	2	6	2981	2986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475684
67	NC_012028	GTTGTC	2	12	3006	3017	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222475684
68	NC_012028	AGT	2	6	3070	3075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475684
69	NC_012028	GTG	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475684
70	NC_012028	GCG	2	6	3117	3122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475684
71	NC_012028	GTAC	2	8	3167	3174	25 %	25 %	25 %	25 %	222475684
72	NC_012028	GAT	2	6	3296	3301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475684
73	NC_012028	AGC	2	6	3333	3338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475684
74	NC_012028	GAA	2	6	3416	3421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475684
75	NC_012028	ACT	2	6	3434	3439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475684
76	NC_012028	TTC	2	6	3489	3494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475684
77	NC_012028	CG	3	6	3498	3503	0 %	0 %	50 %	50 %	222475684
78	NC_012028	GTC	2	6	3572	3577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475684
79	NC_012028	GTA	2	6	3587	3592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475684
80	NC_012028	CGA	2	6	3796	3801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475684
81	NC_012028	CAG	2	6	3820	3825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475684
82	NC_012028	AAG	2	6	3890	3895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475684
83	NC_012028	AC	3	6	3937	3942	50 %	0 %	0 %	50 %	222475684
84	NC_012028	AGCA	2	8	3947	3954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012028	CTAA	2	8	3961	3968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012028	ATG	3	9	4001	4009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475685
87	NC_012028	CTC	2	6	4082	4087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475685
88	NC_012028	GAC	2	6	4105	4110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475685
89	NC_012028	CGA	2	6	4139	4144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475685
90	NC_012028	ATC	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475686
91	NC_012028	CAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475686
92	NC_012028	CCT	2	6	4257	4262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475686
93	NC_012028	AG	3	6	4272	4277	50 %	0 %	50 %	0 %	222475686
94	NC_012028	ATC	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475686
95	NC_012028	GCG	2	6	4384	4389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475686
96	NC_012028	ACTCAG	2	12	4403	4414	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222475686
97	NC_012028	TGC	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475686
98	NC_012028	GAA	2	6	4441	4446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475686
99	NC_012028	AG	3	6	4482	4487	50 %	0 %	50 %	0 %	222475686
100	NC_012028	AACT	2	8	4527	4534	50 %	25 %	0 %	25 %	222475686
101	NC_012028	CGT	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475686
102	NC_012028	CGA	2	6	4722	4727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475686
103	NC_012028	CGG	2	6	4845	4850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475686
104	NC_012028	CAG	2	6	4969	4974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475686
105	NC_012028	GATGG	2	10	5156	5165	20 %	20 %	60 %	0 %	222475686
106	NC_012028	TCC	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475686
107	NC_012028	ACG	2	6	5197	5202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475686
108	NC_012028	GAC	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475686
109	NC_012028	GTG	2	6	5250	5255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475686
110	NC_012028	CTA	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012028	GTAA	2	8	5312	5319	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012028	CTA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012028	ATT	2	6	5448	5453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012028	CTT	2	6	5491	5496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012028	GAA	2	6	5502	5507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012028	GGC	2	6	5630	5635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012028	GCC	2	6	5653	5658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_012028	TCG	2	6	5662	5667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012028	GTT	2	6	5707	5712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012028	AAATC	2	10	5792	5801	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_012028	GAA	2	6	5820	5825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012028	CAG	2	6	5865	5870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012028	GA	4	8	5889	5896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012028	AGC	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475687
125	NC_012028	CGA	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475687
126	NC_012028	CAG	2	6	6030	6035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475687
127	NC_012028	CGT	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475687
128	NC_012028	GAA	2	6	6206	6211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475687
129	NC_012028	AGA	2	6	6249	6254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475687
130	NC_012028	TTCCG	2	10	6336	6345	0 %	40 %	20 %	40 %	222475687
131	NC_012028	CGA	2	6	6370	6375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475687
132	NC_012028	CAT	2	6	6448	6453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475687
133	NC_012028	GCT	2	6	6460	6465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475687
134	NC_012028	GAGC	2	8	6592	6599	25 %	0 %	50 %	25 %	222475687
135	NC_012028	TTG	2	6	6603	6608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475687
136	NC_012028	GACGG	2	10	6620	6629	20 %	0 %	60 %	20 %	222475687
137	NC_012028	CGA	2	6	6652	6657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475687
138	NC_012028	TGA	2	6	6676	6681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475687
139	NC_012028	AGTC	2	8	6744	6751	25 %	25 %	25 %	25 %	222475687
140	NC_012028	GAT	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475687
141	NC_012028	AAC	2	6	6836	6841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475687
142	NC_012028	TCC	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475687
143	NC_012028	GTG	2	6	6966	6971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475687
144	NC_012028	AGC	2	6	7011	7016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475687
145	NC_012028	CTAA	2	8	7020	7027	50 %	25 %	0 %	25 %	222475687
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147	NC_012028	AGG	2	6	7142	7147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475688
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149	NC_012028	TCT	2	6	7196	7201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475688
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151	NC_012028	ACG	2	6	7298	7303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475688
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153	NC_012028	TGC	2	6	7443	7448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475688
154	NC_012028	AAG	2	6	7492	7497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475688
155	NC_012028	ACA	2	6	7521	7526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475688
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157	NC_012028	TCC	2	6	7694	7699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_012028	AGA	2	6	7712	7717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475689
159	NC_012028	AG	3	6	7759	7764	50 %	0 %	50 %	0 %	222475689
160	NC_012028	T	6	6	7792	7797	0 %	100 %	0 %	0 %	222475689
161	NC_012028	G	6	6	7822	7827	0 %	0 %	100 %	0 %	222475689
162	NC_012028	CAG	2	6	7835	7840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475689
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164	NC_012028	TAC	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475689
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166	NC_012028	CAT	3	9	7949	7957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475689
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238	NC_012028	CGG	2	6	12074	12079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
239	NC_012028	CACT	2	8	12086	12093	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
240	NC_012028	TCGA	2	8	12094	12101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
241	NC_012028	CT	3	6	12113	12118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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250	NC_012028	CAA	2	6	12710	12715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_012028	G	6	6	12757	12762	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
252	NC_012028	AG	3	6	12763	12768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
253	NC_012028	GT	3	6	12808	12813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
254	NC_012028	GATGAC	2	12	12934	12945	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222475694
255	NC_012028	CTT	2	6	12969	12974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475694
256	NC_012028	TGA	2	6	12986	12991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475694
257	NC_012028	CG	3	6	13049	13054	0 %	0 %	50 %	50 %	222475694
258	NC_012028	CCA	2	6	13095	13100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475694
259	NC_012028	CGA	2	6	13125	13130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475694
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261	NC_012028	GCA	2	6	13180	13185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475694
262	NC_012028	CGA	2	6	13338	13343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475694
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264	NC_012028	TCC	2	6	13424	13429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475694
265	NC_012028	CTC	2	6	13435	13440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475694
266	NC_012028	AAC	2	6	13552	13557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475694
267	NC_012028	GAT	2	6	13681	13686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475694
268	NC_012028	CTG	2	6	13687	13692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475694
269	NC_012028	TAC	2	6	13753	13758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475694
270	NC_012028	GAT	2	6	13788	13793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475694
271	NC_012028	CACG	2	8	13845	13852	25 %	0 %	25 %	50 %	222475694
272	NC_012028	GCG	2	6	13915	13920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475694
273	NC_012028	GAC	3	9	13948	13956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475694
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276	NC_012028	GAC	2	6	14311	14316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475694
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280	NC_012028	TCA	2	6	14375	14380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475694
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285	NC_012028	ACG	2	6	14684	14689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475694
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380	NC_012028	CAT	2	6	19009	19014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475697
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386	NC_012028	GAAG	2	8	19359	19366	50 %	0 %	50 %	0 %	222475697
387	NC_012028	CAT	2	6	19386	19391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475697
388	NC_012028	AGG	2	6	19394	19399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475697
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391	NC_012028	TCC	2	6	19649	19654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475697
392	NC_012028	GAC	2	6	19714	19719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475697
393	NC_012028	CGA	2	6	19758	19763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475697
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395	NC_012028	TTGC	2	8	19899	19906	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
396	NC_012028	TGG	2	6	20009	20014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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398	NC_012028	ACA	2	6	20092	20097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_012028	CGG	2	6	20106	20111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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